手机浏览器扫描二维码访问
第三十七章 孟德尔随机化（第2页）
差异表达基因就是在疾病状态下与正常状态相比，表现出显著表达差异的基因。
第二步：随机化采样
有了数据之后，陈飞便开始进入实验的核心步骤——随机化设计。
孟德尔的豌豆实验中，随机化是为了消除实验中的人为偏差，每次他从不同的豌豆品种中随机选择个体进行杂交实验，这种方法使得实验结果更具可信度。
孟德尔随机化正是将这个思想引入了现代RNA-seq数据分析。
在他的设计中，他将癌症组和健康对照组的数据进行多次随机化采样。
通过反复随机抽样，他能够确保每次抽取的样本都能代表总体的真实情况。这种方法极大地减少了数据噪音，确保筛选出的差异基因更具生物学意义。
“就像孟德尔反复进行豌豆杂交一样，我也要在这批数据里反复筛选。”陈飞默默念道，手指飞快地在键盘上敲打。采样工作虽然枯燥，但非常关键。
第三步：差异基因分析
随机化采样完成之后，接下来就是关键的差异基因分析步骤了。陈飞使用了R语言中的“DESeq2”包，这是RNA-seq数据分析中非常常用的工具包，专门用来识别差异表达基因。
作为一个苦逼的生物领域搬砖人，陈飞甚至都没有下载过R语言的软件，但是系统君的实验思路写的非常认真，直接让他去参考转码人救星CSDN，
在指导下，陈飞很快安装好了R语言以及RSstudio。
一切准备就绪，可以开大了！
参考着github上一些前人的代码，一顿CtrlC，CtrlV之后，陈飞吭吭哧哧地写完了所有代码。在经历了python界面一次一次error，debug之后，他终于能够让代码运行了。
“看看这数据，”陈飞盯着屏幕上弹出的结果，目光锐利。
经过多次随机化采样和差异基因分析，他成功筛选出了肝细胞癌中显著异常表达的基因。
其中，有几个基因的差异尤为显著，它们在癌症样本中被高度激活，而在健康对照组中几乎没有表达。
这种差异引发了陈飞的浓厚兴趣：“这些基因很可能就是肝细胞癌的核心驱动因素。”
他将这些基因一一标记出来，接下来，他还需要进一步确认这些基因的作用。
第四步：基因调控网络的构建
光有差异表达的基因还不够，陈飞知道，基因之间并不是孤立的，它们通过复杂的调控网络来共同发挥作用。
因此，系统让陈飞构建一个基因调控网络，以便找出那些真正推动肝细胞癌发展的“核心节点”。
基因调控网络可以看作是基因的“社交圈”，某些基因在网络中扮演着关键角色，它们通过调控其他基因的表达，最终影响疾病的发展。
找出这些关键基因，就像抓住了疾病的“领袖”。
“我们要找的就是这些领袖基因。”陈飞说着，将所有筛选出的差异基因输入到网络分析软件中。
嫁给豪门植物人大佬后 她死后，薄爷跪在墓碑前哭成狗 穿为龙傲天的情敌 漂亮影帝在虫族钓疯了 小狗主播的扮演任务又失败了 吞天成圣主角秦斩 尤物娘娘爬凤位，皇上盛宠下旨封后 忍冬 造谣大佬对我情有独钟后 黑神话：加入反抗者联盟 港综：卧底和联胜，从四九到龙头 蝶 一觉醒来和教导主任结婚了 七零男主恶毒小妈，但躺赢 低级癖好 流放前夕，我强上了病弱将军 暗黑神话：这个大唐不对劲！ 活人深处 从历史到神话 废材又怎样？我的徒弟都是战神！
重生八零之极品军妻
吃货林思念重生到了八零年，面对这桩谋算来的婚姻，男人的冷漠，她却像打了鸡血似的，誓要把男主拿下。男人的冷漠与误会让她终于有了离开的想法，可军婚不好离，她不信邪的为离婚奋斗着。可这冷漠的男人从什么时候起，紧紧的追着她的脚步，还恬不知耻的要和她生儿子。呸，谁要和你生儿子？你有儿子了好不好，要生也是生一个像她一样漂亮可爱...
绝代名师
市二中的金牌老师孙默落水后，来到了中州唐国，成了一个刚毕业的实习老师，竟然有了一个白富美的未婚妻，未婚妻竟然还是一所名校的校长，不过这名校衰败了，即将摘牌除名，进行废校处理孙默的开局，就是要帮助未婚妻坐稳校长之位，让学校重回豪门之列。孙默得到绝代名师系统后，点废成金，把一个个废物变成了天才，在孙默的指导下，学渣...
蜀山魔门正宗
蜀山有玄门正宗，一家独大。主角修炼的是魔门正宗。群号紫云宫22117110。...
永恒之心
外门弟子陈宇，体内融入了一颗神魔心脏。心脏，乃生命中枢，人体致命的要害。而对陈宇来说，心脏却是防御最强的一点，并让他拥有赶超妖兽神兽的无限潜力。自此，他踏上一段波澜壮阔荡气回肠的玄奇之旅。天才如云之，天骄盖世。宗门林立之，我主沉浮。万族辉煌之，跨界大战。太古悬谜之，神话争锋。我心唯有，永恒！新书，迫切需要推...
（快穿）欲之咒
简介白秋意身中诅咒，若没有解药，浑身就如同被人剔骨刮肉一样痛男人的精液，就是她的解药第一个世界闺蜜绿了我之后，我睡了她哥小片段白秋意借字多难听啊，不如我卖身给你吧，她往季裴承那边靠了靠，声音压低，妹妹还是雏哦，哥哥可以给妹妹破个瓜嘛。你看我像是随便给人破瓜的人？季裴承。去床上。季裴承道。你硬了吗？白秋意问。季裴承没说话，直接把她的手牵过来，往胯间按。小弟弟好精神呀，白秋意道，哥就在这里要了妹妹吧，妹妹湿哒哒的走不动。你说话一直这么没遮拦？那要看对谁了，对你是的～阅读小贴士1女主非善类，为达目的可以出卖身体的那种QωQ2女主三观不代表本作者三观QωQ3每个世界的男女主不一定是处QωQ关于收费按千字50的标准收费，每个故事都会免费一些章节关于更新日更，有事会在留言板留言点击我要评分可以给作者投珠每天可以免费投送两颗珍珠哦...
穿越大周(武唐风流)
李逸飞，大唐前太子李贤之子，因其父被武则天毒害，从小就被逍遥老人收养，十年之后，学艺有成的李逸飞下山报仇，最后经过与武则天的一番较量终于将女皇降服，成功光复李唐江山，揽江山美人于一身，享受人间帝王之风流。...